Arlequin

Предоставляет большой набор основных методов для получения информации о
генетических и демографических особенностях наборов генетико-популяционных данных.
Анализы подразделены на две основные категории: внутрипопуляционные и
межпопуляционные методы. Использованы процедуры, которые минимизируют скрытые
предположения и являются можно более мощными — перестановочные и точные
критерии.

Официальный сайт программы Arlequin

Составитель чаще всего использует уникальные процедуры определения гаплотипов и
сравнение их частот.
В публикациях следует ссылаться на статью:
Excoffier, L. and H.E. L. Lischer (2010) Arlequin suite ver 3.5: A new series of programs to
perform population genetics analyses under Linux and Windows. Molecular Ecology Resources.
10: 564−567. https://doi.org/10.1111/j.1755−0998.2010.2 847.x#nbsp ;— Цитируется 13 596 раз.
Инструкцию по использованию можно изучить по ссылке